A organização de competições no futebol do Piauí começou muito antes da Federação ser criada. Duas ligas – uma em Parnaíba e outra em Teresina -, disputavam a hegemonia do esporte bretão no território piauiense. E ambas faziam o seu campeonato.

A Liga de Parnaíba, muito mais forte, era a que tinha o reconhecimento da CBD (hoje CBF). Mas a outra liga, por ser na capital, também tinha um certo prestígio. Mas foi o Decreto nº 3.199, de 14/04/1941, assinado pelo então presidente Getúlio Vargas, que definiu o fim da disputa e a criação das Federações não apenas no Piauí, mas em todo o país. E com sede obrigatória nas capitais.

Em face desta legislação federal, era criada a Federação Piauiense de Futebol, no dia 25 de abril de 1941, tendo como primeiros filiados os clubes Automóvel, Artístico, Botafogo, Flamengo e Terríveis. Para primeiro presidente, foi escolhido o desportista Raymundo Ney Baumann, que seria presidente por um longo período, só deixando o cargo em 1960.

O futebol no Piauí era totalmente amador. Somente em 1963 foi adotado o regime profissional, oportunidade em que a entidade teve seu nome modificado para Federação Piauiense de Desportos.

Em 1991, porém, por ocasião das comemorações de seu cinqüentenário de fundação, a FPD teve seu nome alterado para Federação de Futebol do Piauí, oportunidade em que também teve aprovado o seu novo escudo, desenhado sob a inspiração do escudo da Confederação Sul-Americana de Futebol.

O Campeonato Piauiense, promovido pela Federação de Futebol do Piauí, é realizado desde 1941, mas todos os vencedores das competições realizadas anteriormente, em Parnaíba e Teresina, são legitimamente reconhecidos como campeões do Piauí.